Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmod1P49813 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmod1P49813 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmod1P49813 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmod1P49813 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmod1P49813 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tmod1P49813 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tmod1P49813 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tmod1P49813 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tmod1P49813 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tmod1P49813 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tmod1P49813 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tmod1P49813 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tmod1P49813 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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