Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp3P49194 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp3P49194 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp3P49194 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp3P49194 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms