Protein–RNA interactions for Protein: P47879

Igfbp4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp4P47879 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igfbp4P47879 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp4P47879 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms