Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms