Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms