Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms