Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KdrP35918 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KdrP35918 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KdrP35918 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KdrP35918 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KdrP35918 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KdrP35918 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms