Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcam1P29533 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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