Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aco1P28271 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms