Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RdxP26043 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RdxP26043 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RdxP26043 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RdxP26043 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RdxP26043 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RdxP26043 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RdxP26043 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RdxP26043 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms