Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms