Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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