Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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