Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp1P11438 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp1P11438 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp1P11438 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp1P11438 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp1P11438 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms