Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RaraP11416 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RaraP11416 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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