Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms