Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P10404 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P10404 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
P10404 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P10404 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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