Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms