Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms