Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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