Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sap30O88574 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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