Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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