Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52l1O54818 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52l1O54818 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52l1O54818 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52l1O54818 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms