Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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