Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms