Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq1O09165 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Casq1O09165 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Casq1O09165 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Casq1O09165 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Casq1O09165 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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