Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ube3aO08759 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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