Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm21310J3QQ23 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21310J3QQ23 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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