Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 AC123935.1-201ENSMUST00000225588 409 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Gm21887J3QQ04 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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