Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms