Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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