Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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