Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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