Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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