Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms