Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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