Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms