Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rnf212F6TQD1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rnf212F6TQD1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf212F6TQD1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms