Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
ApobE9Q414 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms