Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms