Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms