Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms