Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc8B2RUS7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms