Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud7bB2RUR8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms