Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms