Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms