Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms