Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf3B2KF05 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms