Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2B1AVH7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms