Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trabd2bB1ATG9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms